超濾離心管的使用
注:本文引自“分子莊園”公眾號,略有修改。
超濾離心管是一種膜過濾設(shè)備,是用于分離液體中不同分子或粒子的裝置。它利用特殊的超濾膜,通過應(yīng)用壓力將液體樣品推動穿過膜,從而分離不同分子或粒子的大小,廣泛用于蛋白質(zhì)、DNA和生物分子的濃縮、純化和脫鹽。
一、超濾與微濾
1、微濾
微濾 (Microfiltration) 涉及利用微孔膜介質(zhì)去除溶液中尺寸為 0.1 μm 至 10.0 μm 的顆?;蛏矬w。而超濾膜的過濾范圍為0.01μm至0.1μm。
微濾膜廣泛應(yīng)用于生物制藥行業(yè)中的預(yù)過濾和除菌過濾。 在細胞實驗中,微濾最常用于樣品和培養(yǎng)基的滅菌(0.1μm微濾膜可去除支原體)。
此外,在核酸和蛋白質(zhì)分析之前,使用微濾膜可以有效地從細胞裂解物中去除完整的細胞和細胞碎片。 此步驟對于確保下游應(yīng)用中結(jié)果的準確性至關(guān)重要。 通過微濾,研究人員可以獲得純化的樣品,從而提高核酸和蛋白質(zhì)相關(guān)研究的靈敏度和特異性。
2、超濾
超濾 (Ultrafiltration) 也是一種膜過濾,通過壓力或濃度梯度等力使料液通過半透膜進行分離。 超濾膜能夠截留尺寸范圍為1-1000kDa(MW)的分子,并允許鹽和水等小分子通過。
超濾是大分子脫鹽、濃縮最方便的方法,已經(jīng)在蛋白、抗體、病毒、核酸、囊泡等樣品制備中建立標準操作。與沉淀法相比,超濾法更為溫和,避免了可能導(dǎo)致生物大分子失活的相變。
水流的方向垂直于膜的表面,能最大限度的提高水通量,在壓力差的作用下,水和小于膜孔的顆?;蛭镔|(zhì)透過膜,大于膜孔的顆粒則被膜截留。死端過濾隨著過濾時間的延長,被截留顆粒將在膜表面形成污染層,阻塞膜孔,使過濾阻力增加,在操作壓力不變的情況下,膜的過濾透過率將下降;而增加壓力則可能是膜破裂。因此,死端過濾只能間歇進行,必須周期性地清除膜表面的污染物層或更換膜。又叫錯流過濾(cross flow filtration):水流的方向平行于膜的表面,可以大量減少污染物在表面的富集,因為水流會將其帶走,同時也減少了堵孔的概率,使膜的通量能夠保持,同時,膜上面承受的壓力也更小,可以延長膜的使用壽命。錯流過濾運行時,水流在膜表面產(chǎn)生兩個分力,一個是垂直于膜面的法向力,使水分子透過膜面,另一種是平行于膜面的切向力,把膜面的截留物沖刷掉。因此,錯流過濾的濾膜表面不易產(chǎn)生濃差極化現(xiàn)象和結(jié)垢問題,過濾透過率衰減較慢。錯流過濾的運行方式比較靈活,既可以間歇運行,又可以實現(xiàn)連續(xù)運行。
三、超濾離心管
超濾離心管是一種利用離心力驅(qū)動中小體積溶液通過超濾膜,進行快速濃縮、滲濾和緩沖液置換的裝置。 它由蓋子、過濾裝置和離心管組成。
中間的過濾裝置既可用于滲透樣品,也可以用于保留樣品。當目標分子明顯小于濾膜孔徑時,可使用超濾離心管對大分子污染物進行除熱源、澄清和分離。目標樣品會透過濾膜并保留在離心管內(nèi)。如果目標分子遠大于膜孔徑,則小分子污染物將被濾除,目標分子將集中在過濾裝置中。垂直設(shè)計的超濾膜具有更大的有效濾膜表面積,有助于快速的樣本處理,獲得較高的樣本回收率(通常>90%),并達到數(shù)十倍的濃縮,同時也最大程度降低了大顆?;虼蠓肿恿课镔|(zhì)堵塞濾膜。死體積設(shè)計能有效防止過度離心使樣本干掉而造成樣本損失。
收集濾出液后,濃縮樣本(截留部分)可通過一個簡便的倒置(上下反轉(zhuǎn))離心步驟而實現(xiàn)高效回收。反轉(zhuǎn)離心回收設(shè)計使蛋白樣品,特別是小體積樣品得到高效回收,避免槍頭吸取造成的樣品丟失或操作錯誤。
超濾管采用切向流過濾技術(shù),是一種以篩分為分離原理,以壓力為推動力的膜分離過程。用于截留水中顆粒和大分子物質(zhì),而水和小分子物質(zhì)則允許透過膜,過濾精度在0.001-0.01μm(分子量1kD-1000kD)范圍內(nèi),可有效除去有機溶劑或者小分子物質(zhì),相反,也可以截留水中的微粒、膠體、細菌、熱源及高分子聚合物。選擇超濾離心管需要考慮樣品起始量以及超濾膜的截留分子量(MWCO)。影響截留和產(chǎn)物回收率的因素有很多,如分子構(gòu)象、帶電特性、樣品濃度、操作條件等。而且超濾管上的截留分子量只是平均孔徑,實際孔徑是在左右正太分布的。
一般建議選擇截留分子量要比要濃縮的目標大分子的分子量小2-3倍的超濾膜,然后根據(jù)要處理的樣品體積選擇不同尺寸的超濾離心管。
為防超濾膜干裂和長菌,通常超濾離心管內(nèi)會附帶少量甘油和疊氮化鈉用于保護和儲存,在使用前需潤洗去除。一般是向超濾裝置中加入純水、去離子水或緩沖溶液,離心使溶液完全過膜,然后離心管中的所有液體。如果干擾仍然存在,可用0.1 M NaOH清洗,再用20%的乙醇清洗,最后用緩沖液或超純水水清洗并甩干。超濾膜一旦潤濕后就需保持濕潤避免變干直至使用結(jié)束,如果預(yù)清洗后沒有立即使用,可用20%的乙醇浸泡保存,務(wù)必保持濾膜潤濕,防止長菌。
5、超濾管的放置
超濾管在離心機中的擺放需要符合切向流過濾要求,即水流方向與膜面平行。
1)水平轉(zhuǎn)子
使用水平轉(zhuǎn)子時放置沒有特殊要求。
水平轉(zhuǎn)子又稱甩平轉(zhuǎn)子、蕩平轉(zhuǎn)子,轉(zhuǎn)頭靜止時,處于轉(zhuǎn)頭中的離心管中心線與旋轉(zhuǎn)軸平行,轉(zhuǎn)頭旋轉(zhuǎn)加速時,離心管中心線由平行位置逐漸過渡到垂直位置,即與旋轉(zhuǎn)軸成90?角。此種轉(zhuǎn)子主要用于樣品做密度梯度離心,顆粒移動距離長,相應(yīng)離心時間一般也較長,溶液中的組分相對于管壁的位置在離心過程中和離心后不發(fā)生改變,因此離心效果好,能夠分離密度差小的樣品。
2)固定角轉(zhuǎn)子
使用角轉(zhuǎn)子時,雙面垂直膜超濾管放置方式要求濾膜側(cè)向相對。
單面垂直膜要求濾膜膜面朝下,這樣濾膜才能發(fā)揮切向流的作用。
有尖角的超濾管應(yīng)使尖角朝上以便樣品進入尖角,讓樣品收集更加方便,此外,死體積設(shè)計能有效防止過度離心使樣本干掉而造成樣本損失。固定角轉(zhuǎn)子中離心管與轉(zhuǎn)子的轉(zhuǎn)軸之間有一定的角度,角度變化范圍通常在14?-45?。此種轉(zhuǎn)子重心低,壽命長,容量較大,轉(zhuǎn)速較高,能承受的最大離心力可達800000g,主要用于分離沉降速度有明顯差異的顆粒樣品。顆粒在扇形溶液移動的距離很短,碰到外壁的顆粒沿著管壁滑到管底,形成沉淀,因此這種轉(zhuǎn)子能很快地收集沉淀物。
6、超濾管的截留分子量和膜孔徑關(guān)系
超濾管是一種膜過濾設(shè)備,用于分離液體中不同分子或粒子的裝置。它利用特殊的超濾膜,通過應(yīng)用壓力將液體樣品推動穿過膜,從而分離不同分子或粒子的大小。這種分離過程基于分子截留量,也就是膜的孔徑大小,決定了哪些分子可以通過膜,哪些分子被截留在膜上。
分子截留量是表示超濾膜的選擇性的重要參數(shù),通常以道爾頓(Da)為單位,分子截留率表示膜可以截留的最大分子或粒子的大小。具體來說,如果膜的分子截留率是10kD,則該膜能夠截留分子量小于或等于10000的分子,而分子量大于10000的分子將被截留在膜上。
道爾頓是用來表示分子質(zhì)量或原子質(zhì)量的單位,一個分子的道爾頓數(shù)值大約等于其相對原子質(zhì)量或相對分子質(zhì)量。
截留分子量和孔徑之間的關(guān)系是復(fù)雜的。通常超濾膜的截留分子量是指在一定條件下,某些分子量的物質(zhì)被膜截留,被截住物質(zhì)的最小分子量即為膜的截留分子量,用以表征膜的分離能力;而孔徑則是反映膜的通透性的重要參數(shù)。分子量通常用單位為Dalton(Da)表示,而孔徑大小通常用單位為納米(nm)表示。
超濾膜截留的分子量10000、30000、50000 60000、100000、200000、300000、500000、1000000,對應(yīng)超濾膜孔徑(μm) 0.01、0.02、0.03、0.04、0.05、0.06、0.07、0.08、0.1。也就是說100kd(10萬)的截留分子量對應(yīng)50nm的孔徑。
從數(shù)據(jù)上看,似乎存在一種對應(yīng)關(guān)系,如超濾膜截留分子量為100kD(10萬)時,對應(yīng)的孔徑為0.05μm。但這種關(guān)系并不完全準確。因為超濾膜的孔徑和分子量的關(guān)聯(lián)并非簡單的線性關(guān)系,對于具體的過濾器或分離膜,其材料、制備方法、孔徑大小分布等因素都會影響它們之間的關(guān)系。
7、超濾管的離心
超濾管如果離心轉(zhuǎn)速過高,可能會導(dǎo)致膜甚至管子的破裂,做實驗時要根據(jù)不同品牌超濾管的說明書中明確指出的最大轉(zhuǎn)速和離心力,調(diào)整離心轉(zhuǎn)速到超濾管的承受范圍內(nèi)。
離心機的轉(zhuǎn)速與離心機的半徑以及離心力都有關(guān)系,不同半徑的離心機,相同轉(zhuǎn)速出來的離心力也不一樣。離心力g和rpm(轉(zhuǎn)/min)轉(zhuǎn)換公式:g=r×11.8×10??×rpm2,其中g(shù)有時用相對離心力(RCF)表示。
r 為有效離心半徑,即從離心機軸心到離心管底的長度,單位為厘米(cm)。
8、超濾管使用建議
1)超濾管不能進行高壓滅菌,可使用70%乙醇或環(huán)氧乙烷滅菌。
2)超濾管一般不建議重復(fù)使用超過5次。受到樣品性質(zhì)的影響,先用0.1M的NaOH浸泡1-2h,然后用20%乙醇清洗,最后用超純水或緩沖液清洗3次,即可再用。
3、如果樣品是線性蛋白,需使用較低的離心速度和時間避免蛋白降解。
4、濃縮過快或者過度濃縮可能會引起蛋白沉淀。建議蛋白濃縮后最終濃度不超過20mg/ml,同時降低離心速度并改用截留分子量更大的超濾管。
建議的改進方法是:①離心力降為推薦離心力的30%-50%;②改用截留分子量大的超濾管(如原本選用10kD,此時可以選擇30kD);③取出超濾管, 用吸頭反復(fù)吹吸幾次后再繼續(xù)濃縮。
6、過濾速率受到超濾管MWCO,樣品濃度,粘度,離心力和溫度的影響。如果樣品中固體含量超過5%,離心時間需要增加。當在4℃下運行時,流速大約比25℃時慢1.5倍。粘性溶液(如50%甘油)的濃縮時間大概是常規(guī)溶液的5倍。
7、如果要用超濾的方法分離兩種蛋白,按照經(jīng)驗,兩個蛋白的分子量要相差一個數(shù)量級(10 倍)。
8、擔心濃縮過程中目的蛋白和超濾膜之間可能存在非特異性吸附,可嘗試以下操作:①確保蛋白濃度不要過低;②盡量選用纖維素的低吸附超濾;③選用小體積超濾管,通過減小膜面積來降低非特異性吸附;④使用前可以先對膜進行封閉:1%脫脂奶粉,1%BSA,5%Tween 20,5%SDS,5%TritonX-100,5%PEG3000(不影響蛋白活性,不影響蛋白后續(xù)使用的前提下)。
9、對于有些樣品含量非常少的情況,可嘗試一下操作:①盡量選擇較小的截留分子量的超濾管;②選擇帶有尖角收集器的超濾管以便最大限度回收樣品;③使用水平轉(zhuǎn)子優(yōu)于角轉(zhuǎn)子;④濃縮完用緩沖液清洗多次回收, 注意移液器的槍頭不要碰到膜,以免膜破裂;⑤使用前可以先對膜進行封閉。